探索未知区域是无尽的拉格朗日的核心玩法之一，玩家需要通过情报收集任务逐步揭开星系地图的迷雾。完成主线探索任务时，需将地图视角拉远至合理位置，通过双指缩放操作触发黑暗区域的探索图标，随后派遣舰队建立计划圈即可启动探索流程。这一机制要求玩家具备基础的空间感知能力，避免因视野局限而遗漏关键区域。
资源采集与探索密不可分，工程舰的配置直接影响探索效率。建议优先建造AC721重型运载驱逐舰和中型工程舰，前者能显著提升仓储运输能力，后者则大幅提高采矿速度。在计划圈布局时，应将矿点控制在计划圈边缘以缩短工程舰航行距离，同时搭配运载型舰船减少往返频率。前哨站的战略部署同样重要，既能作为资源中转站，也可通过经济模式地图定位高等级矿点。
舰船强化是支撑深度探索的技术基础。不同舰型需针对性加点，例如运载型舰船优先强化仓储系统，战斗舰艇则需平衡火力与防御属性。子型号研究进度直接影响舰船性能上限，但获取难度较高。合理利用蓝图研究系统，结合战斗经验获取技术值，才能逐步解锁舰船的完整潜力。载机舰与护航艇的协同作战也值得关注，其特殊攻击模式在特定场景下能发挥关键作用。
情报探索任务分为常规探索与公会探索两类，后者需达到特定会员等级方可参与。执行过程中可能遭遇突发战斗，建议配置具备防空能力的护卫舰应对无人机袭击。Boss级敌人的出现需要评估舰队实力，若暂时无法战胜可先积累资源强化装备。探索奖励包含稀有蓝图、技术值和战略物资，这些资源对后期舰队建设具有持续性价值。
中立者协议为探索提供了特殊助力，该机制允许玩家通过加密通信与私人掠夺者建立临时合作。在特洛伊水晶采集等特殊协议中，中立者能利用合作点兑换稀缺资源。但需注意保持隐蔽性，过度暴露坐标可能导致战略资源点被争夺。跃迁技术的运用也需谨慎，虽然能快速转移舰队位置，但在准备阶段遭遇攻击会导致行动中断。
