击败四大天王成为冠军后，游戏并未结束，而是开启了更丰富的冒险内容。首先需要完成图鉴升级，收集超过60种不同精灵后前往大木博士研究所，将关都图鉴升级至386全国图鉴。升级后的图鉴会显示更多精灵信息，为后续探索提供便利。完成这一目标后，玩家可以前往枯叶市港口，使用船票乘坐船只前往七之岛，开启全新的岛屿探索任务。
七之岛是火红版新增的核心区域，包含多个岛屿和隐藏剧情。在一岛火焰山击败火箭队成员后，进入山洞使用怪力技能推开岩石，深处可获得红宝石。随后前往四岛冰洞，利用登瀑布技能找到冰系天王科拿，协助她击败火箭队并获取仓库密码。五岛仓库需要两道密码才能进入，其中一道需在六岛通过特定机关解谜获得蓝宝石后换取。仓库内关押着被火箭队捕获的稀有精灵，解救它们是重要任务之一。
岛屿探索过程中会遇到多只传说宝可梦。三圣鸟中的急冻鸟位于四岛右侧子岛，需冲浪抵达；火焰鸟在冠军之路深处；闪电鸟则需在发电厂附近触发事件。超梦仍是最强传说精灵，需在华蓝洞窟最深处挑战，建议携带大师球或高等级队伍应对。七之岛训练家塔提供高强度对战，适合检验队伍实力并获取稀有道具。
完成岛屿主线后，玩家可重复挑战四大天王和冠军，其精灵等级会随进度提升。这一机制为练级和赚取金币提供稳定途径。游戏内隐藏要素如技能教学、树果种植和精灵交换等玩法值得深入挖掘。部分特殊进化方式如通信进化需借助外部设备，但单机模式下可通过剧情NPC实现部分需求。
图鉴完成度直接影响游戏完成度评价，部分稀有精灵仅能在特定天气或时间段出现。建议系统规划捕捉路线，合理分配资源。火红版后期内容设计兼顾探索与战斗，玩家可根据偏好选择深度体验或休闲游玩。
