开局布阵是决定胜负的关键因素之一。合理的布阵能最大化发挥忍者特性，掌握战斗主动权。开局跑位分为两种情况：若对手是远程技能消耗型忍者，建议开局往反方向跑，避开试探性技能；若对手是短手体术型忍者，可选择斜上方或斜下方跑位，既能观察对手位置，又能避免撞上突进技能。跑位方向需灵活多变，防止被对手预判。
忍者选择与站位布局需根据战斗风格调整。速攻型阵容强调快速压制，通常采用横排站位，前排放置防御型或高爆发忍者，中后排配置输出型角色。例如初代火影千手柱间适合作为1手位承担压力，3手位和4手位则选择高连招效率的忍者。九宫格布阵系统允许自由搭配，但需注意普攻优先攻击同路目标，而奥义可手动选择目标，因此技能释放时机需精准把控。
开局阶段避免盲目突进，优先通过普攻和走位试探对手。远程预判技能需保持一屏外的安全距离，观察对手跑位轨迹后出手。突进型忍者需确保敌方关键技能处于冷却状态，成功命中后立刻衔接普攻连招。替身术的使用时机尤为关键，既可规避伤害，也能制造反击机会。秘卷和通灵兽的搭配需结合忍者特性，例如霸体秘卷适合近战，而控制类秘卷可打断对手节奏。
决斗场对局需保持冷静，避免因习惯性跑位或技能滥用暴露破绽。开局阶段需观察敌方忍者类型和站位，及时调整策略。若对手采用消耗战术，可通过走位拉扯创造反击空间；若对手强攻，则需利用地形和技能间隙反制。持续练习忍者熟练度，熟悉技能后摇和无敌帧，是提升胜率的核心。
阵容需兼顾羁绊加成与实战适配性。例如鸣人与佐助的第七班羁绊可提升防御，而我爱罗与李洛克的中忍考试羁绊增强生存能力。平民玩家可选择鹿丸、杜门李等易获取且强度稳定的忍者，通过操作弥补战力差距。决斗场平衡机制下，合理布阵与战术执行比单纯战力更重要。
每场对局后复盘跑位失误和技能空档，能有效优化布阵策略。
